Основними завданнями і функціями Управління є:
1. організація, забезпечення охорони державної таємниці та контроль її стану в ДПС та її територіальних органах;
2. організація та забезпечення технічного захисту інформації, контроль за його станом;
3. організація криптографічного захисту інформації з обмеженим доступом та контроль його стану;
4. організація, координація заходів захисту інформації в інформаційно-телекомунікаційних системах та контроль за його станом в ДПС та її територіальних органах;
5. організація та координація заходів забезпечення антивірусного захисту та кіберзахисту інформації в інформаційно-телекомунікаційних системах ДПС та її територіальних органів та контроль за їх станом.