Основними завданнями Департаменту є:
1. Участь у реалізації та вдосконаленні комплексної Системи запобігання та протидії легалізації (відмиванню) доходів, одержаних злочинним шляхом, і фінансуванню тероризму через виконання законів України, указів та доручень Президента України, постанов Верховної Ради України, актів Кабінету Міністрів України, інших нормативно-правових актів та розпорядчих документів ДПС;
2. Організація роботи в органах ДПС щодо виявлення, аналізу та перевірки фінансових операцій, які можуть бути пов’язані з легалізацією (відмиванням) доходів, одержаних злочинним шляхом, або фінансуванням тероризму.
Основними функціями Департаменту є:
1. Вжиття заходів щодо виявлення, аналізу, організації та проведення перевірок осіб, які здійснюють фінансові операції, що можуть бути пов’язані з легалізацією (відмиванням) доходів, одержаних злочинним шляхом, або з фінансуванням тероризму;
2. Забезпечення виконання Угод щодо автоматичного обміну інформацією про фінансові рахунки (FATCA і CRS) з компетентними органами інших держав;
3. Організація роботи щодо комплексного відпрацювання суб’єктів господарювання за галузевим принципом;
4. Здійснення заходів щодо забезпечення виконання прийнятих у встановленому законом порядку рішень про застосування спеціальних економічних та інших обмежувальних заходів (санкцій) до платників податків, у тому числі як невідкладних заходів із розв'язання кризових ситуацій, що загрожують національній безпеці України.